Новосибирск, 22 - 26 июня 2025 г.

Научная программа

Программа конференции

Устный доклад - 20 минут + 5 минут на вопросы. Формат презентации 16:9.

Постерные сессии пройдут 24 и 26 июня. Постеры желательно представлять в форматах B1, А0 или А1. Любой из этих форматов можно оперативно распечать в Paparazzi (Морской проспект 27).

 

Расписание секций

22 июня - Открытие конференции (18:00), пленарные лекции:

Роль 3D генома в регуляции транскрипции

  • Пётр Сергиев, чл.-корр. РАН (НИИ Физико-химической биологии МГУ).

Чем определяется скорость созревания разных РНК?

23 июня

  • Белок-НК, НК-НК взаимодействия и трансляция
  • Новые платформы и методы NGS
  • Геномика одиночных клеток

24 июня

  • Постерная сессия
  • Геномика микроорганизмов и вирусов
  • Метагеномика

25 июня

  • Геномика животных

26 июня

  • Постерная сессия
  • Медицинская геномика
  • Закрытие конференции

 

Устные и постерные доклады

 

Белок-НК, НК-НК взаимодействия и трансляция

  • Нариман Баттулин (Институт цитологии и генетики СО РАН). 3D-геномика интерфазы: анализ роли когезина и конденсинов в ядерной архитектуре
  • Алексей Белогуров (Институт биоорганической химии РАН). Мутационный дрейф способствует высвобождению протеасомой популяционных CD8+ T-клеточных эпитопов из рецептор-связывающего домена вируса SARS-CoV-2 варианта Омикрон и его текущих подтипов.
  • Елизавета Золотёнкова (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН). Гидроксилирование рибосомного белка uL15 необходимо для корректной работы рибосомы в процессе трансляции
  • Екатерина Комарова (НИИ Физико-химической биологии МГУ). Toe-seq – новый подход к изучению специфичности ингибиторов трансляции к нуклеотидной последовательности мРНК
  • Алексей Малыгин (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН). Landscape of the translatome in NSUN2-deficient HEK293T cells
  • Анастасия Матвеева (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН). Создание и NGS-характеризация линий клеток человека, экспрессирующих неприродные варианты малых ядрышковых РНК
  • Мария Рубцова (Химический факультет МГУ им. М.В. Ломоносова). Полногеномный поиск функциональных малых открытых рамок считывания

 

Новые платформы и методы NGS

  • Григорий Аникин (MGI). Опыт исследования пространственной транскриптомики в России и обновления линейки секвенаторов DNBSEQ
  • Сергей Долгушин (ООО "Полупроводниковые генетические технологии"). Разработка основных функциональных блоков для отечественного полупроводникового секвенатора нуклеиновых кислот
  • Марсель Кабилов (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН). Баркодирование праймеров для метабаркодинга.
  • Антон Пушкин (ООО "НПФ Синтол"). Отечественное комплексное решение для массового параллельного секвенирования ДНК
  • Александр Сергеев (Химический факультет МГУ им. М.В. Ломоносова). Проблемы нанопорового секвенирования G/C-богатых областей промоторов онкогенов
  • Полина Талайкина (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН). Spike-in для 16S метабаркодинга
  • Диана Уразаева (ФНКЦ Физико-химической медицины ФМБА). Оптимизация и применение протокола подготовки библиотек Т-клеточных рецепторов для секвенирования на платформе MGISEQ
  • Артем Фадеев (НИИ гриппа имени А.А.Смородинцева») Опыт применения платформы для секвенирования CYGNUS для полногеномного анализа SARS-Cov-2

 

Геномика одиночных клеток

  • Александр Бобровских (Новосибирский государственный университет). Анализ данных секвенирования транскриптома одиночных клеток семенников серой полевки рода Microtus
  • Олег Гусев (Институт Биохимии и генетики УФИЦ РАН, Juntendo University). Транскриптомнный контроль холодовой спячки эмбрионов птиц на уровне отдельных клеточных популяций
  • Евгений Денисов (НИИ онкологии Томского НИМЦ РАН). Иммунный ландшафт опухолей на уровне единичных клеток: поиск маркеров и мишеней
  • Кирилл Елфимов (Центр Вирусологии и Биотехнологии "Вектор"). Транскриптомный профиль единичных клеток при ВИЧ-инфекции: CRF63_02A6 ВИЧ-1 и его влияние на экспрессию генов мононуклеаров периферической крови
  • Семён Колмыков (Научно-технологический университет «Сириус»). Evaluating the Impact of Pioneer Factors Activity on Reproducibility of Bulk and Single-Cell ATAC-seq Data
  • Анна Хозяинова (НИИ онкологии Томского НИМЦ РАН). Пластичность опухолевых клеток за пределами эпителиально-мезенхимального перехода
  • Екатерина Храмеева (Сколковский институт науки и технологий). 3D-геном нейронов человека: анализ данных Hi-C c разрешением в одну клетку
  • Павел Ямщиков (Центр системной биоинформатики Томского НИМЦ РАН). Сравнительный пространственный транскриптомный анализ центра и инвазивного края опухоли яичников

 

Геномика микроорганизмов и вирусов

  • Александр Авшалумов (ФНКЦ Физико-химической медицины ФМБА). Изучение обратимого переключения фенотипа адгезивно-инвазивной E.coli методом случайного транспозонного мутагенеза
  • Евгения Быстрицкая (Тихоокеанский институт биоорганической химии ДВО РАН). Таксономика и геномика клады Mediterranei рода бактерий Vibrio
  • Елизавета Гончарова (НИЦ эпидемиологии и микробиологии Н.Ф.Гамалеи). Адаптационный потенциал представителей семейства Enterobacteriaceae, хронически инфицирующих пациентов с муковисцидозом
  • Петр Евсеев (Пироговский Университет). Изучение эволюционной истории фагов семейства Mesyanzhinovviridae: анализ генома фага Pseudomonas Lydia и родственных бактериофагов
  • Евгений Коротков (ФИЦ Фундаментальные основы биотехнологии РАН). Зеркально-комплементарные кодоны в дисперсных повторах в геномах многих бактерий
  • Андрей Кульбачинский (Институт биологии гена РАН). Поиск новых защитных систем прокариот: от геномики к практике
  • Виктория Лавренова (МГУ им. М.В. Ломоносова). Использование геномных и транскриптомных данных для предсказания коллагенолитических ферментов Aspergillus ustus
  • Ксения Малышева (НИИ по изысканию новых антибиотиков). Биоразнообразие, молекулярно-генетическая идентификация и антимикробные свойства коллекции грибов рода Emericellopsis
  • Олег Огарков (НЦ «Проблем здоровья семьи и репродукции человека»). Высоковирулентный субтип Beijing B0/W148 Mycobacterium tuberculosis: филогенетический анализ и геномные  маркеры для эпидемиологического надзора
  • Юлия Савичева (Тихоокеанский институт биоорганической химии ДВО РАН). Геномный анализ биосинтеза сульфатированного полисахарида Vibrio sp. KMM 9700
  • Екатерина Храмцова (НИИ по изысканию новых антибиотиков Г.Ф. Гаузе). Уточнение таксономического положения Streptomyces Albidoflavus ИНА01303 методами микробиологии и полногеномного секвенирования
  • Цао Юань (МГУ имени М.В.Ломоносова). Деградом мукоромицета Absidia spinosa

 

Метагеномика

  • Евгений Андронов (ВНИИ сельскохозяйственной микробиологии). Универсальный метагеномный диагностикум для почвенного микробиома: стратегии создания
  • Мария Антонец (Институт систематики и экологии животных СО РАН). Первые обнаруженные вирусы колорадского жука
  • Ольга Воронина (НИЦ эпидемиологии и микробиологии им. Н.Ф. Гамалеи). Влияние комбинированной терапии на состав микробиома мокроты хронически инфицированных больных муковисцидозом
  • Иван Дубовский (Новосибирский государственный аграрный университет). Использование почвенной микробиоты для усиления роста и защиты растений
  • Марина Исаева (Тихоокеанский институт биоорганической химии ДВО РАН). Изучение таксономического состава микробных сообществ дальневосточных морей методами культивирования и глубокого секвенирования ампликонов 16S рибосомной РНК
  • Елена Минчева (Байкальский музей СО РАН). Метабаркодинговое исследование разнообразия сообществ обрастания пластика в озере Байкал
  • Алёна Науменко (Новосибирский государственный университет). Таксономический анализ микробных сообществ на основе 16S рРНК и ITS с помощью платформы QIIME 2

 

Геномика животных

  • Татьяна Бикчурина (Новосибирский государственный университет). Близкородственные виды серых полевок рода Microtus как модель гибридной стерильности: гистологический, цитогенетический и транскриптомный анализ
  • Екатерина Буденчук (Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН). Филогенетическое положение представителей вымершего вида зайцев Сибири
  • Екатерина Иванова (Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН). Повторенные последовательности в геномах мунтжаков
  • Екатерина Каманова (Институт цитологии и генетики СО РАН). Функциональный анализ транскрипционного ответа личинок колорадского жука на инфекцию энтомопатогенными грибами Beauveria bassiana и Metarhizium robertsii
  • Михаил Карташов (ГНЦ ВБ "Вектор" Роспотребнадзора). Разнообразие митохондриальных геномов клещей Dermacentor reticularus (Acari: Ixodida) в различных регионах России
  • Максим Клещев (НИИ нейронаук и медицины). Transcriptomic analysis of zebrafish (Danio rerio) telencephalon after laser-induced traumatic brain injury: neuroinflammation and neurogenesis impairment.
  • Алла Красикова (Санкт-Петербургский государственный университет). Транскрипция тандемных повторов ДНК в оогенезе позвоночных
  • Мария Куслий (Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН). Приготовление проб для обогащения геномных библиотек вымерших видов животных Сибири на основе данных высокопроизводительного секвенирования
  • Алина Нугуманова (НТУ «Сириус»). Изменение профиля метилирования в рамках всего генома CD3+ лимфоцитов после иммунизации мышей мРНК  вакциной
  • Анастасия Проскурякова (Институт молекуляной и клеточной биологии СО РАН). Сравнительная геномика птиц надотряда Galloanseres
  • Ульяна Роцкая (Институт систематики и экологии животных СО РАН). Экспрессия генов иммунного ответа у колорадского жука в ответ на грибные инфекции; перспективы РНК-интерференции генов иммунно-сигнальных путей
  • Снежана Самарина (Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН). Генетическое разнообразие древних и современных обыкновенных лисиц (Vulpes vulpes) Сибири на основе последовательностей мтДНК
  • Катерина Тишакова (Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН). Характеризация и цитогенетическая локализация сателлитной ДНК логгерхеда (Caretta caretta, Testudines)
  • Вадим Цейликман (Челябинский государственный университет). Полнотранскриптомный анализ влияния ресвератрола на печень крыс при хроническом стрессе
  • Арюна Цыренжапова (Казанский (приволжский) федеральный университет). Аннотация цис-регуляторных элементов, активных в эмбриональных стволовых клетках птиц, на основе CAGE-секвенирования.
  • Артём Яковлев (ИМКБ СО РАН). Расширение территории распространения гаплогруппы C степных зубров сибири на основе митогеномных данных

 

Медицинская геномика

  • Юрий Вяткин (Новосибирский государственный университет, ООО “Новые Программные Системы”). Интерпретация геномных данных в больших когортах пациентов, секвенированных NGS
  • Надежда Дырхеева (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН). Влияние нокаута по генам белков репарации ДНК TDP1 и PARP1 и ингибитора TDP1  на транскриптом клеток линии НЕК293А
  • Дарья Жигалина (Томский национальный исследовательский медицинский центр РАН). Продукт MDA как основа для преимплантационного генетического тестирования анеуплоидий и моногенных болезней
  • Андрей Зуев (НИИ медицинской генетики Томского НИМЦ). Применение полногеномного секвенирования со сверхнизким покрытием в диагностике случаев комбинированных хромосомных аномалий у спонтанных абортусов
  • Иван Киселев (НМИЦК им. ак. Е.И. Чазова). Поиск перспективных биомаркеров перехода радиологически изолированного синдрома в рассеянный склероз методом секвенирования РНК
  • Антон Кутихин (НИИ комплексных проблем сердечно-сосудистых заболеваний). Полнотранскриптомный анализ экспрессии генов, обеспечивающих функционирование первичных эндотелиальных клеток артерий и вен человека
  • Александр Осадчук (Институт цитологии и генетики СО РАН). Полноэкзомная диссекция мужского репродуктивного фенотипа: значение этнической изменчивости
  • Максим Синицкий (НИИ комплексных проблем сердечно-сосудистых заболеваний). Результаты полностранскриптомного секвенирования клапанов сердца, пораженных инфекционным эндокардитом
  • Анастасия Федоренко (НИИ онкологии ТНИМЦ РАН). Транскрипционные особенности иммунных клеток крови у больной раком молочной железы, ответившей на химиотерапию
  • Анна Чеснокова (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН). Изменения транскриптома опухоли GL261 при инфекции онколитическим вирусом VV-GMCSF-Lact и инъекциях GM-CSF человека
  • Екатерина Шутко (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН). Поиск диагностических и прогностических микроРНК-маркеров рака предстательной железы с помощью NGS
  • Анатолий Шлихт (Дальневосточный Федеральный Университет). Инструментальная система моделирования и интерпретации высокоструктурированных омиксных данных